新修訂的《海關(guān)稽查條例》主要修改內(nèi)容有：
  一是增加了對海關(guān)實(shí)施稽查具有保障和支撐作用的基礎(chǔ)性措施。《決定》規(guī)定，海關(guān)根據(jù)稽查工作需要，可以向有關(guān)行業(yè)協(xié)會(huì)、政府部門和相關(guān)企業(yè)等收集特定商品、行業(yè)與進(jìn)出口活動(dòng)有關(guān)的信息，并根據(jù)有關(guān)企業(yè)、單位的進(jìn)出口信用狀況和風(fēng)險(xiǎn)狀況確定海關(guān)稽查重點(diǎn)。
  二是進(jìn)一步規(guī)范和優(yōu)化海關(guān)稽查程序。《決定》將海關(guān)不經(jīng)事先通知進(jìn)行稽查的情形明確限定為被稽查人有重大違法嫌疑，其賬簿、單證等有關(guān)資料以及進(jìn)出口貨物可能被轉(zhuǎn)移、隱匿、毀棄等緊急情況;將稽查報(bào)告送被稽查人征求意見的情形限定為“稽查報(bào)告認(rèn)定被稽查人涉嫌違法”，并僅就“稽查報(bào)告認(rèn)定的事實(shí)”征求意見。《決定》取消了使用計(jì)算機(jī)記賬、核算的有關(guān)企業(yè)、單位應(yīng)當(dāng)將會(huì)計(jì)記錄打印成書面記錄保管的規(guī)定;還刪去要求有關(guān)企業(yè)、單位向海關(guān)報(bào)送進(jìn)出口貨物購買、銷售、加工、使用、損耗和庫存情況資料的規(guī)定。
  三是完善海關(guān)稽查職權(quán)和措施。《決定》增加了扣押強(qiáng)制措施方面的規(guī)定，并明確可以查封、扣押相關(guān)電子數(shù)據(jù)存儲(chǔ)介質(zhì);同時(shí)增加了海關(guān)可以委托會(huì)計(jì)、稅務(wù)等方面的專業(yè)機(jī)構(gòu)就相關(guān)問題作出專業(yè)結(jié)論的規(guī)定;被稽查人委托專業(yè)機(jī)構(gòu)作出的專業(yè)結(jié)論，可以作為海關(guān)稽查的參考依據(jù)。
  四是寬嚴(yán)相濟(jì)懲處違法行為。《決定》提高了對違法行為的罰款數(shù)額。同時(shí)規(guī)定，與進(jìn)出口貨物直接有關(guān)的企業(yè)、單位主動(dòng)向海關(guān)報(bào)告其違反海關(guān)監(jiān)管規(guī)定的行為，并接受海關(guān)處理的，應(yīng)當(dāng)從輕或者減輕行政處罰。
  與舊條例相比，新修訂的《海關(guān)稽查條例》將“推行簡政放權(quán)、激發(fā)企業(yè)和市場活力”作為一項(xiàng)重要的內(nèi)容，將會(huì)對自治區(qū)外貿(mào)企業(yè)產(chǎn)生深遠(yuǎn)影響。
  新修訂的《海關(guān)稽查條例》明確了企業(yè)主動(dòng)披露制度成為一個(gè)亮點(diǎn)。該制度鼓勵(lì)企業(yè)對海關(guān)尚未發(fā)現(xiàn)的問題主動(dòng)上報(bào)，促進(jìn)企業(yè)自我規(guī)范、誠信經(jīng)營，使海關(guān)與企業(yè)由過去單一的管理者與被管理者的關(guān)系轉(zhuǎn)變?yōu)楣餐芾怼４送猓肷鐣?huì)專業(yè)機(jī)構(gòu)參與海關(guān)稽查，是新修訂的《海關(guān)稽查條例》的另一大亮點(diǎn)，這對于整合利用社會(huì)資源、提高公共服務(wù)水平和效率具有重要意義。
  “新稽查條例的實(shí)施，有利于創(chuàng)新海關(guān)監(jiān)管實(shí)現(xiàn)方式，促進(jìn)自治區(qū)進(jìn)出口企業(yè)守法規(guī)范經(jīng)營，保障被稽查企業(yè)合理權(quán)利，進(jìn)一步降低企業(yè)負(fù)擔(dān)。”